Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ca4Q64444 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ca4Q64444 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms