Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb1Q64318 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zeb1Q64318 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms