Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpd52Q62393 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms