Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tgfbr2Q62312 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfbr2Q62312 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tgfbr2Q62312 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tgfbr2Q62312 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tgfbr2Q62312 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tgfbr2Q62312 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfbr2Q62312 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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