Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sprr1aQ62266 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sprr1aQ62266 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sprr1aQ62266 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms