Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PcolceQ61398 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PcolceQ61398 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PcolceQ61398 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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