Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacna1eQ61290 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms