Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms