Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf2Q59J78 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms