Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms