Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod2Q3UHZ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod2Q3UHZ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod2Q3UHZ5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms