Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK8

Tnrc6a, Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6aQ3UHK8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnrc6aQ3UHK8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms