Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zyg11bQ3UFS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zyg11bQ3UFS0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms