Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd8Q3UFK8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms