Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trafd1Q3UDK1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms