Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms