Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ulk3Q3U3Q1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ulk3Q3U3Q1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ulk3Q3U3Q1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ulk3Q3U3Q1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk3Q3U3Q1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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