Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt2Q3TTY5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms