Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vax1Q2NKI2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms