Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN3Q13064 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN3Q13064 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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