Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmntd2Q0VET5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmntd2Q0VET5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms