Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pglyrp4Q0VB07 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pglyrp4Q0VB07 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms