Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms