Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cass4Q08EC4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cass4Q08EC4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms