Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Calb2Q08331 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calb2Q08331 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms