Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf4Q06507 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms