Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Apoc2Q05020 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Apoc2Q05020 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Apoc2Q05020 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Apoc2Q05020 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apoc2Q05020 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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