Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox9Q04887 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms