Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms