Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms