Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms