Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb2Q00977 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms