Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms