Protein–RNA interactions for Protein: P98199

Atp8b2, Phospholipid-transporting ATPase ID, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b2P98199 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8b2P98199 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms