Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcdP82347 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms