Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ErfP70459 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ErfP70459 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ErfP70459 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ErfP70459 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ErfP70459 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ErfP70459 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms