Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms