Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms