Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfixP70257 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfixP70257 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfixP70257 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfixP70257 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfixP70257 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfixP70257 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfixP70257 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NfixP70257 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NfixP70257 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms