Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Acta1P68134 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Acta1P68134 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Acta1P68134 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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