Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps27aP62983 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps27aP62983 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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