Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psme3P61290 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms