Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab5bP61021 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms