Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PctpP53808 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PctpP53808 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PctpP53808 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PctpP53808 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PctpP53808 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PctpP53808 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms