Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec1P51908 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms