Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5P49615 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms