Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox2P48432 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms