Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CratP47934 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CratP47934 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CratP47934 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CratP47934 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CratP47934 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CratP47934 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CratP47934 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CratP47934 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms