Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl6P47911 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms