Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rph3aP47708 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rph3aP47708 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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